La "Fondazione" è gestita da un Consiglio Direttivo composto da un numero di componenti pari a quello del Consiglio dell'Ordine dei Dottori Commercialisti di Lecce, dai componenti pro-tempore del Consiglio dell'Ordine, attualmente previsto in numero 15. Il Consiglio rimane in carica di regola per un triennio e, comunque, per lo stesso tempo in cui rimane in carica il Consiglio dell'Ordine. Le nomine e la scadenza di quest'ultimo coincidono con quelle della Fondazione. Al Consiglio Direttivo è attribuita l'amministrazione ordinaria e straordinaria della Fondazione. Per il compimento di determinate attività istituzionali può nominare consulenti e collaboratori che lo affianchino. La Fondazione è assistita da un Comitato Scientifico nominato dal Consiglio e composto da un numero di membri variabile da cinque a undici, nominati tra personalità del mondo delle professioni, della cultura e dell'università che si siano particolarmente distinti nei campi in cui opera la Fondazione. Il Comitato Scientifico ha funzione consultiva e di orientamento per tutte le attività istituzionali della Fondazione e predispone un apposito programma scientifico ai fini della elaborazione dei programmi e delle attività della Fondazione.